Oportunidades de fomento

Oportunidades Vigentes

Edital Fapesb nº 24/2010 - Programa de Apoio a Núcleos de Excelência (Pronex)

O Edital Fapesb nº 24/2010 - Pronex tem por objetivo apoiar atividades de pesquisa científica, tecnológica e de inovação, mediante a seleção de propostas para apoio financeiro a projetos de grupos consolidados, visando a dar suporte financeiro aos trabalhos dos referidos grupos, vinculados a instituições de ensino superior e/ou pesquisa, públicas ou privadas (sem fins lucrativos), sediadas no Estado da Bahia, e com atuação nas diversas áreas do conhecimento.

Data Limite: Até as 17h30min do dia 17 de fevereiro de 2011.

Home Page: http://www.fapesb.ba.gov.br/?page_id=4040

Edital Fapesb nº 25/2010 - Programa Primeiros Projetos (PPP)

O Edital Fapesb nº 25/2010 - Programa Primeiros Projetos (PPP) tem por objetivo apoiar atividades de pesquisa científica, tecnológica e de inovação, através da seleção de propostas para apoio financeiro à aquisição, instalação, modernização, ampliação e/ou recuperação da infraestrutura de pesquisa nas instituições de ensino superior, publicas ou privadas (sem fins lucrativos) localizadas no Estado da Bahia, visando dar suporte à fixação de jovens pesquisadores (doutores) e a nucleação de novos grupos de pesquisa, em quaisquer áreas do conhecimento.

Data Limite: Até as 17h30min do dia 3 de fevereiro de 2011. Home Page: http://www.fapesb.ba.gov.br/?page_id=4055

Omics Meets Cell Biology (Conference Student Scholarships)

The mission of the Keystone Symposia is to serve as a catalyst for the advancement of biomedical and life sciences by connecting scientists within and across disciplines at conferences and workshops held at venues that create an environment conducive to information exchange, generation of new ideas, and acceleration of applications that benefit society.

The Keystone Symposia is offering scholarships to participants of the Meeting "Omics Meets Cell Biology", which will be held May 8 - 13, 2011, Alpbach, Austria. Follow these links to download the Meeting Summary, theMeeting Flyer and the Meeting Program.

Data Limite: January 6, 2011.

Home Page: https://www.keystonesymposia.org/Meetings/viewMeetings.cfm?MeetingID=1087&subTab=scholarships

Lipid Biology and Lipotoxicity (Conference Student Scholarships)

The Keystone Symposia is offering scholarships to participants of the Meeting "Lipid Biology and Lipotoxicity", which will be held May 15 - 20, 2011, Killarney, Co. Kerry, Ireland. Follow these links to download the Meeting Summary, the Meeting Flyer and the Meeting Program.

Data Limite: January 13, 2011 (Midnight US Mountain Standard Time). Home Page: http://www.keystonesymposia.org/Meetings/viewMeetings.cfm?MeetingID=1113&subTab=scholarships

CIHR's Fellowships 2010-2011

The Canadian Institutes of Health Research (CIHR) is the Government of Canada's agency responsible for funding health research in Canada. CIHR was created in 2000 under the authority of the CIHR Act and reports to Parliament through the Minister of Health. 

The CIHR's Fellowships provide support for highly qualified candidates at the post-PhD or post-health professional degree stages to add to their experience by engaging in health research either in Canada or abroad.

Data Limite: February 1, 2011.

Home Page: aqui

Molecular Evolution Fellowship Program

The Smithsonian Postdoctoral Fellowship in Molecular Evolution is offered to support research at the Smithsonian Institution. The Smithsonian's molecular research facilities are located at National Museum of Natural History (NMNH), National Zoological Park (NZP), in the Washington, D.C. area, and at the Smithsonian Tropical Research Institute (STRI), in the Republic of Panama, but collaboration with other facilities (Smithsonian Environmental Research Center [SERC], Museum Conservation Institute [MCI], etc.) is encouraged. 

Included in the proposal evaluation will be it's relevance in terms of the Smithsonian’s Strategic Plan and how the research reflects one or more of the Four Grand Challenges outlined in the plan.

Data Limite: All applications must be postmarked by January 15, annually. Home Page: http://www.si.edu/ofg/Applications/MEFELL/MEFELLapp.htm

Tupper 3-Year Postdoctoral Fellowships in Tropical Biology

The Smithsonian Tropical Research Institute (STRI) located in the Republic of Panama is a division of the Smithsonian Institution in Washington DC and maintains research facilities in different marine and terrestrial locations on the Isthmus of Panama. STRI invites applications for the Earl S. Tupper three-year postdoctoral fellowship in the areas represented by its scientific staff. 

Disciplines include ecology, anthropology, paleontology, paleoecology, evolutionary biology, molecular phylogenetics, biogeography, animal behavior, neurobiology, soils sciences, and physiology of tropical plants and animals. Research should be based at one of the STRI facilities; proposals that include comparative research in other tropical countries will be considered. One fellowship is awarded annually.

Data Limite: This program is made on a annual basis. Application deadline is January 15 each year.

Home Page: http://www.stri.si.edu/english/education_fellowships/fellowships/tupper.php

Tinker Visiting Professorship Program at the University of Wisconsin-Madison

The Latin American, Caribbean and Iberian Studies Program (LACIS) at the University of Wisconsin-Madison, are a Title VI National Resource Center, in operation since 1973 in consortium with the University of Wisconsin-Milwaukee Center for Latin American and Caribbean Studies (CLACS).

LACIS coordinates and supports teaching, research and outreach on campus and in the community. Its mission as a resource center and as an academic program, is threefold:

1.             To train Latin Americanist specialists for academic, government, and private sectors;

2.             To support Latin Americanist students and faculty in their intellectual development so that they can become and remain superior teachers and scholars;

3.            To serve as a local, regional, and national resource center that provides outreach, support services, and information to other university units, K-16, government, civic, community and business constituencies.

LACIS provides a variety of grant opportunities for affiliated faculty. Tinker Visiting Professorship Program is an excellent means to relieve curriculum gaps, complement departmental strengths, and to establish more informal collaborations among faculty and students. Tinker Professors at the University of Wisconsin-Madison are required to teach or co-teach one course during the semester of residence and to provide, in addition, one public lecture.

Data Limite:The nomination deadline is the last Friday in January annually. Home Page: http://www.lacis.wisc.edu/index.php?q=node/32

Molecular Basis of Bacterial Infection: Basic and Applied Research Approaches (Wellcome Trust Advanced Course)

The Wellcome Trust is an independent charity funding research to improve human and animal health. Established in 1936 and with an endowment of around £10 billion, it is the UK's largest non-governmental source of funds for biomedical research. The Wellcome Trust Genome Campus is set in the idyllic grounds of the Hinxton Hall estate, south of Cambridge. 
Wellcome Trust Advanced Courses provide practical training in the latest biomedical research techniques and bioinformatics tools for senior PhD students, postdocs and clinicians. 

The "Molecular Basis of Bacterial Infection: Basic and Applied Research Approaches" is an intensive one-week course (8-14 May 2011) which will introduce participants to concepts and techniques currently used in studies on the molecular basis of bacterial infection. Several themes will run throughout the week and these will provide a framework for bench experiments, demonstrations, supporting lectures and discussion groups. Core themes will include tissue-based assays, reporters, tissue culture assays, and microscopy (fluorescent and scanning/transmission electron microscopy).

Data Limite: 28 January 2011. Home Page: http://www.wellcome.ac.uk/Education-resources/Courses-and-conferences/Advanced-Courses/Courses/WTX026211.htm

Fomento e Infraestrutura em P&D

Coordenação de Pesquisas -Vice-Diretoria de Pesquisas e Desenvolvimento Tecnológico

Fiocruz Bahia

Precisamos de suplementação de Vitamina D?

O papel das vitaminas sobre o sistema imune tem sido tratada no SBlogI (aqui) e a Vitamina D tem recebido bastante atenção: foi comentado o seu envolvimento na maturação da avidez do linfócito T, a sua relação com a resistência à infecção assim como foi comentado o trabalho que a implica na atenuação da resposta Th2 em pacientes.

A pergunta deste post não é se precisamos de Vitamina D. É indiscutível que precisamos, mas precisamos de suplementação de Vitamina D? A dose ideal de Vitamina D é muito difícil de ser obtida apenas com uma dieta normal e está ausente do leite materno, contudo ela é produzida a partir de um precursor que é encontrado na pele e naturalmente produzido no organismo. Ao sofrer a ação da luz UV (da luz do sol, por exemplo) o precursor é convertido numa molécula que chega ao fígado pela circulação. Aí se transforma num prohormônio que nos rins pode ser convertido na Vitamina D. Durante muito tempo, vendeu-se a idéia que seria necessária uma suplementação alimentar.

No dia 30 de novembro passado, o Institute of Medicine, da National Academies of Science, divulgou um relatório sobre o consumo de Vitamina D e cálcio e alterou as doses diárias recomendadas  (Dietary Reference Intakes for Calcium and Vitamin D). 

Os pontos principais são:

“The committee provided an exhaustive review of studies on potential health outcomes and found that the evidence supported a role for these nutrients in bone health but not in other health conditions. Overall, the committee concludes that the majority of Americans and Canadians are receiving adequate amounts of both calcium and vitamin D. Further, there is emerging evidence that too much of these nutrients may be harmful.”

Ou seja, não há deficiência nas quantidades obtidas por estadunidenses e canadenses e pode mesmo haver dano por ingestão excessiva. E no caso do Brasil? com a quantidade de luz solar que há no Brasil é difícil imaginar um deficit, mesmo que a ingestão alimentar não seja elevada.

Veja as recomendações diárias:

É sempre adequado estar atento à possibilidade que a recomendação de produtos não necessários, ou pelo menos não necessários nas doses indicadas, esteja ligada ao objetivo de vender medicamentos ou suplementos alimentares. Há vários artigos  no tema e Lynn Payer listou os dez mandamentos para a fabricação bem-sucedida de uma nova doença:

1. Tomar uma função normal e insinuar que há algo de errado com ela e que precisa ser tratada;
2. Encontrar sofrimento onde ele não necessariamente existe;
3. Definir uma parcela tão grande quanto possível da população afetada pela "doença";
4. Definir a condição como uma moléstia de deficiência ou como um desequilíbrio hormonal;
5. Encontrar os médicos certos;
6. Enquadrar as questões de maneira muito particular;
7. Ser seletivo no uso de estatísticas para exagerar os benefícios do tratamento disponibilizado;
8. Eleger os objetivos errados;
9. Promover a tecnologia como magia sem riscos;
10. Tomar um sintoma comum, que possa significar qualquer coisa, e fazê-lo parecer um sinal de alguma doença séria.”

Veja mais sobre a fabricação de doenças (aqui).

Bactérias comensais do gênero Clostridium promovem células T reguladoras no intestino.

O intestino é um orgão bastante interessante. Abriga mais de 100 trilhões de bactérias comensais de 30-40 espécies diferentes, 10 vezes mais do que o número de células do organismo inteiro. Apresenta mais linfócitos do que todo o resto do corpo humano, e esses linfócitos geralmente apresentam um fenótipo de ativação. Linfócitos Th1, Th17 e Treg parecem conviver lá em perfeita harmonia. Portanto, a mucosa intestinal é capaz de gerar uma resposta imune eficiente sem ameaçar a tolerância à antígenos inócuos. Ultimamente muito se tem estudado sobre o papel de diferentes bactérias comensais na diferenciação/manutenção dos diferentes tipos de células T efetoras presentes no intestino (Round & Mazmanian 2009).

Em um artigo publicado na Science express no dia 23 de dezembro, o grupo liderado por Kenya Honda da Yakult Central Institute for Microbiological Research em Tóquio, Japão mostra que bactérias comensais do gênero Clostridium, mas não outras bactérias comensais como Bacteroides, são as responsáveis pelo acúmulo de células T reguladoras (Treg) no intestino (Atarashi et al, 2010).

Primeiramente, os autores observaram aumento da frequência de Treg na lâmina propria do cólon e intestino delgado de acordo com a idade dos animais (2 -13 semanas de idade). Em seguida, eles observaram que a frequência de Treg no cólon, mas não no intestino delgado, era menor em animais germ-free do que em animais SPF (specific pathogen free); e quando os animais germ-free foram recolonizados com suspensão fecal de animais SPF, observou-se um aumento da frequência de Treg no cólon. Esses resultados sugerem que a microflora indígena permite acúmulo de Treg no cólon. Os autores também mostraram que o tratamento de animais SPF com vancomicina, antibiótico que ataca bactérias Gram-positivas, resulta na diminuição de Tregs no cólon enquanto que tratamento com polimixina B cujo o alvo é principalmente bactérias Gram-negativas, não afetou a frequência de Treg no cólon. Uma vez que bactérias do gênero Clostridium são uma das principais bactérias Gram-positivas presentes no trato gastro-intestinal de camundongos, os autores apostaram em uma possível ligação entre essas bactérias e a geração/manutenção de Tregs. Para testar essa hipótese, eles colonizaram animais germ-free com um coquetel de 46 cepas de Clostridium e observaram aumento significativo de Treg no cólon mas não no intestino delgado. Para avaliar se esse efeito era especificamente induzido por Clostridium, os autores colonizaram os animais germ-free com outras bactérias também presentes na microbiota como as Bacteroides. Colonização com Bacteroides não resultou em aumento de Treg no colon, sugerindo um efeito específico do Clostridium.

Em seguida, os autores caracterizaram essas Treg induzidas por Clostridium. Uma fração significativa das Treg presentes no colon de animais ex-germ-free (colonizados com Clostridium) não expressa Helios, fator de transcrição que parece ser expresso por Treg naturais (Thornton et al, 2010), sugerindo que essas Treg foram diferenciadas de células T naïve. Uma vez que a produção de IL-10 por Treg está relacionada a sua atividade imunossupressora, o grupo de Honda investigou a produção de IL-10 usando um camundongo knock-in repórter no qual as células produtoras de IL-10 são YFP+ (Il10venus) e observou que as Treg presentes no colon de animais germ-free colonizados com Clostridium, mas não com outras bactérias, produzem IL-10, e não expressam Helios, sugerindo novamente que as Treg acumuladas no cólon foram induzidas a partir de não células T não reguladoras.
O acúmulo de Treg no cólon induzido por Clostridium parece ser independente de sinalização via TLR uma vez que animais germ-free deficientes em MyD88 colonizados com Clostridium apresentam o mesmo aumento de Treg quando comparado aos animais suficientes em Myd88.

Por último, para mostrar a importância de Clostridium na resposta imune regional e sistêmica, eles utilizaram modelo de colite induzida pelo composto químico DSS (dextran sodium sulfate), e modelo de imunização com ovalbumina (OVA). Animais cuja a microbiota era rica em Clostridium desenvolveram colite menos grave; e a imunização com OVA absorvida em Alum resultou em níveis séricos de IgE anti-OVA menores nos animais ricos em Clostridium no intestino. Esses resultados sugerem que o efeito de Clostridium vai além de manter/diferenciar Treg no cólon, influenciado também a resposta imune sistêmica.

Os resultados desse trabalho abre perspectivas para o tratamento de autoimunidade mas também levanta várias outras questões, como: quais as vias de sinalização envolvidas na geração de Treg por Clostridium (já que parece ser independente de TLRs)? Quais os componentes presentes no Clostridium que são reconhecidos pelas células do sistema imune levando a diferenciação/manutenção de Treg no colon? O efeito da colonização por Clostridium é direto nas Treg ou indireto via células dendríticas ou células T efetoras?


Referências

Atarashi K, Tanoue T, Shima T, Imaoka A, Kuwahara T, Momose Y, Cheng G, Yamasaki S, Saito T, Ohba Y, Taniguchi T, Takeda K, Hori S, Ivanov II, Umesaki Y, Itoh K, Honda K. Induction of Colonic Regulatory T Cells by Indigenous Clostridium Species. Science. 2010 Dec 23.

Round JL, Mazmanian SK. The gut microbiota shapes intestinal immune responses during health and disease. Nat Rev Immunol. 2009 May;9(5):313-23. Review. Erratum in: Nat Rev Immunol. 2009 Aug;9(8):600.

Thornton AM, Korty PE, Tran DQ, Wohlfert EA, Murray PE, Belkaid Y, Shevach EM. Expression of Helios, an Ikaros transcription factor family member, differentiates thymic-derived from peripherally induced Foxp3+ T regulatory cells. J Immunol. 2010 Apr 1;184(7):3433-41.

Ganho de Função em MyD88 leva a linfoma de péssimo prognóstico

Post de João Bosco de Oliveira Filho, MD, PhD
Co-director, Flow Cytometry and Genetics, Department of Laboratory Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, USA


Em um trabalho recente (Ngo, V, et al, Nature, Dec 22, e-pub), o grupo de Lou Staudt, NCI/NIH, descreveu o achado de mutações ativadoras em MYD88 em um subtipo específico de linfoma em humanos, chamado ABC-difuse large B cell lymphoma (ABC-DLBCL). O achado é de grande importância, pois este tumor é de difícil tratamento e a delineação das vias precisas de sinalização que modulam a sobrevida das celulas cancerosas abre as portas para o desenvolvimento de terapias específicas. Os pesquisadores identificaram que o ganho de função em MYD88 induziu a ativação de uma plataforma sinalizadora contendo IRAK1 e IRAK4 e levou à hiperativação das vias NF-kB e JAK-STAT, suprimindo a apoptose. Essa mutação tambem cooperou patologicamente com outras mutações comumente encontradas nestes linfomas, nos genes CD79B e CARD11.

Para identificar MYD88 como fator crucial para manutenção deste tumor, Ngo e colegas utilizaram de uma ferramenta bastante poderosa - o screening com bibliotecas de shRNA (short hairpin RNA). Na biblioteca utilizada pelo grupo os hairpins silenciadores de RNA foram expressados em plasmídeos contendo “barcodes” de DNA. Esses plasmídeos foram empacotados em vetores retrovirais e pools de cerca de 1000 shRNAs foram usados para infectar linhagens dos tumores de interesse a um MOI muito baixo, de forma que em média apenas um vírus infectou cada célula. Apos seleção das células infectadas por puromicina, a expressão dos hairpins silenciadores foi induzida com doxiciclina (ou não, nas linhagens controle), e a vitalidade das células mensurada nos dias subsequentes. Ao final do ensaio as linhagens controle e induzidas foram lisadas e o DNA de ambas hibridizado em um mycroarray contendo oligonucleotideos que reconhecem os barcodes, identificando-se desta forma os hairpins que modularam a perda de vitalidade celular. Uma segunda fase, confirmatória, foi então realizada com os principais candidatos. Esse grupo já adotou esta mesma estratégia de forma muito bem sucedida em vários artigos publicados recentemente (Rui, L, et al, Cancer Cell, Dec 14, e-pub; Davis, RE, et al, Nature, 463:88-92).

Para aqueles que pretendem se aventurar no mundo dos screening com shRNA, o uso dos barcodes facilita bastante o experimento, pois evita que o investigador tenha que escanear milhares de shRNA em ensaios individuais. Atualmente varias companhias, como Open Biosystems, vendem pools retrovirias prontos ou grupos de centenas de plasmideos para empacotamento a preços razoaveis, e também os chips para hibridização e identificação dos barcodes.
Ficamos por aqui e boa sorte nos experimentos!

Referências:


Ngo et al. Oncogenically active MYD88 mutations in human lymphoma. Nature. 2010 Dec 22. [Epub ahead of print]

Rui et al. Cooperative epigenetic modulation by cancer amplicon genes. Cancer Cell. 2010 Dec 14;18(6):590-605.

Davis et al. Chronic active B-cell-receptor signalling in diffuse large B-cell lymphoma. Nature. 2010 Jan 7;463(7277):88-92.

Gordon Conference on “Tropical Infectious Diseases"

Dear colleague,

I am writing to alert you of available openings for the second Gordon Conference on “Tropical Infectious Diseases” subtitled “From Bench to Field”.

DESCRIPTION: This small conference (less than 150 participants) will cover malaria, arboviral diseases, cholera, filariasis, leishmaniasis, rickettsiosis and trypanosomiasis. For each disease, discussions will address how progress made at the bench is being translated to actions in the field. The intent is to promote discussions from basic to applied questions and to generate ‘cross-fertilization’ among different specialties and fields of knowledge. It is hoped that a new multidisciplinary network of scientists interested in Tropical Infectious Diseases will emerge.

PROGRAM: here

PLACE & DATES: Hotel Galvez (Galveston, Texas) March 13-18, 2010

COSTS. The $1,025 registration fee covers hotel AND meals.

HOW TO REGISTER. On line application. 

Apply soon: registration closes February 13, 2011.

FINANCIAL SUPPORT may be available on a limited basis, to defray part of the costs. Contact Marcelo Jacobs-Lorena at mlorena@jhsph.edu for details. 

Please help promote the conference by forwarding this information to your colleagues and to members of your laboratory. Feel free to contact me at mlorena@jhsph.edu for any additional information.

Hope to see you in Galveston in March!

                           Marcelo

Células raras do sistema imune

Nós, imunologistas, parecemos dar pouca importância para algumas células raras que compõem o sistema imune. Pouco se fala a respeito de células como basófilos e NKT, por exemplo. Nesse sentido, resolvi tecer alguns comentários de artigos que discutem a importâncias dessas células na indução de respostas imunes.

Descoberto na década de 1870, o basófilo compreende menos de 1% dos leucócitos humanos. Nos últimos anos, algumas funções foram atribuídas a estas células, como as de indução de respostas Th2 e de apresentação de antígenos. Diversos estudos, no entanto, questionam a participação dos basófilos como células apresentadoras de antígenos (APCs). Mitch Leslie, em um comentário da Science, diz que devemos tomar muito cuidado ao afirmarmos que basófilos atuam como APCs. Tang e colaboradores também sugerem que os basófilos não são capazes de apresentar antígenos. Ainda no estudo de Tang e colaboradores, os basófilos foram importantes para a diferenciação de células Th2, já que são importantes fontes de IL-4, mas não estavam envolvidos com a proliferação das células TCD4, função desempenhada pelas células dendríticas (DCs). Dessa forma, a cooperação entre DCs e basófilos foi essencial para a proliferação e indução de células Th2.

Também damos pouca importância para a célula NKT. Em outro trabalho publicado na Nature, De Santo e colaboradores mostraram que células NKT estão envolvidas no controle de tumores; isto porque as células NKT impedem o desenvolvimento do microambiente antiinflamatório induzido pelas células tumorais. Mas como as células NKT agem no combate ao tumor? De Santo observou que pacientes com melanoma apresentaram frequências elevadas de neutrófilos imunossupressivos, com aumento concomitante de amilóide A-1 sérica (SAA-1), uma proteína de fase aguda. Ao analisar o efeito da SAA-1 sobre os neutrófilos in vitro, De Santo verificou que essa proteína de fase aguda era responsável pela indução de neutrófilos imunossupressores. As células NKT foram colocadas em contato com os neutrófilos imunossupressores, e essa interação foi necessária para a reaquisição do fenótipo pro-inflamatório do neutrófilo, capaz de combater a imunossupressão induzida pelas células tumorais.

Qual a sua opinião, caro leitor do blog? Você também compartilha da opinião de que os basófilos não atuam como APCs? Células NKT ficam à margem dos estudos imunológicos? Você acha que damos pouca importância a essas células? Essas células raras são pouco importantes mesmo? Você também teria uma informação curtinha sobre alguma célula rara do sistema imune?

De Santo C, Arscott R, Booth S, Karydis I, Jones M, Asher R, Salio M, Middleton M, Cerundolo V. Invariant NKT cells modulate the suppressive activity of IL-10-secreting neutrophils differentiated with serum amyloid A. Nat Immunol. 2010 Nov;11(11):1039-46.

Leslie M. Immunology. Mouse studies challenge rare immune cell's powers. Science. 2010 Sep 24;329(5999):1595.

Tang H, Cao W, Kasturi SP, Ravindran R, Nakaya HI, Kundu K, Murthy N, Kepler TB, Malissen B, Pulendran B. The T helper type 2 response to cysteine proteases requires dendritic cell-basophil cooperation via ROS-mediated signaling. Nat Immunol. 2010 Jul;11(7):608-17. Epub 2010 May 23.

Tiago Medina, IBA, FMRP-USP.

A imunologia na era dos "omas"

Assim como tudo evoluiu e se modernizou com o passar do tempo, o mesmo vem ocorrendo com o pensamento científico, e surge um “novo modo de se fazer e pensar ciência”. O desenvolvimento científico, que caminhou a passos lentos na idade média, foi alavancado, e passou a sofrer crescimento acelerado a partir do advento do renascimento. Nesta época, surgiram grandes pensadores, que revolucionaram a maneira de se pensar nas coisas, e também de se fazer ciência. René Descartes (1596 – 1650), por exemplo, dizia que o corpo humano pode ser visto como um relógio, e que assim como este, o todo é composto de várias pequenas peças. Sendo assim, se identificássemos as pequenas peças e as estudássemos individualmente, conseguiríamos entender como funciona o todo. Este método consolidado por Descartes, ou método reducionista, foi base do pensamento científico por muitos anos, e responsável pelo incrível desenvolvimento científico observado até o século XX. As pesquisas científicas evoluíram muito nesse período, e a humanidade conseguiu, no caso do corpo humano, chegar às “pequenas peças” que o compõe; como o DNA, por exemplo. Porém, olhando-se e estudando-se uma extensa seqüência de 4 letras aleatoriamente (à primeira vista) dispostas, não conseguimos entender como pode surgir vida daquilo. A coisa é muito mais complexa do que isso. Começou a surgir então um novo modo de olhar para as coisas, e principalmente para organismos vivos. Uma dupla fita de DNA sozinha não faz muita coisa... Entretanto, quando essa fita passa a interagir com outros vários conjuntos de moléculas, as coisas passam a ser diferentes. Uma nova propriedade que não depende unicamente de uma molécula, mas da interação entre várias delas, emerge. O estudo de sistemas biológicos sob este ponto de vista é chamado de biologia de sistemas, ou biologia sistêmica, e sua base é justamente olhar para os sistemas biológicos como um todo, e não individualmente para as pequenas partes que os compõem; estudar os sistemas complexos através da interação que ocorre entre todos os seus componentes, desde interações moleculares até interações com outros organismos, e entender como essas interações fazem emergir as funções e o comportamento destes sistemas. Um pouco da teoria da biologia sistêmica pode ser compreendida neste vídeo: http://www.overstream.net/view.php?oid=upmfubafidu7

Foi assim que começou a era dos “omas”, pois antes de estudar as interações entre os componentes de um sistema biológico, primeiro era necessário identificar e mapear todos esses componentes. Começou-se então com os mais básicos, os genes, com os “projetos genomas”. A partir da identificação de todos os genes, passou-se a mapear também os RNAs originados por esses genes, com os projetos “transcriptomas”. Dos transcritos, passou-se a mapear as proteínas originadas desses RNAs, com os projetos “proteomas”. As interações entre essas proteínas e também delas com outras moléculas passaram também a serem mapeadas em projetos como, por exemplo, os “metabolomas”. Esses projetos são interdisciplinares, e envolvem geralmente aplicação de elementos de biologia, matemática, física e bioinformática, criando algoritmos de alto poder preditivo sobre o comportamento dos sistemas. Pois bem... Não é possível pensar em estudar imunologia olhando-se apenas para uma célula. Quando se pensa em uma resposta imune, logo se pensa em múltiplas interações. O sistema imunológico é, portanto, um sistema extremamente complexo. Sendo assim, muitos dos projetos “omas” estão intimamente relacionados com imunologia. Uma revisão interessante de NITA-LAZAR, SAITO-BENZ e WHITE, 2010, discute a aplicação da “fosfoproteomica” em imunologia. São muitas as modificações pós-traducionais que ocorrem em proteínas e muitas as alterações que essas modificações causam nas funções dessas moléculas. Uma modificação pós-traducional importante é a fosforilação que ocorre em certos resíduos de aminoácidos que podem mudar totalmente a função de uma proteína. O mapeamento de todos os resíduos fosforiláveis de uma proteína é o seu fosfoproteoma. A ativação e supressão de respostas imunes são totalmente dependentes de fosforilações e desfosforilações em resíduos de aminoácidos em proteínas na superfície e interior das células imunes. Sendo assim, a autora discute a possibilidade de se criar mapas de estados de fosforilação das proteínas em células imunes, associados com homeostase, respostas Th1, Th2, Th17, etc. Também é possível estudar como a inclusão de um elemento perturbador do sistema, como um patógeno, vai interferir com este estado de fosforilação. Assim, seria mais fácil predizer em um sistema individual (uma pessoa), como ela poderia responder a este patógeno, e como seria a melhor forma de interferir em sua resposta imune para que ela eliminasse o agente perturbador (lembrando que neste caso também é importante a análise do fosfoproteoma do patógeno, e da inteferência do agente perturbador – resposta imune do hospedeiro – no seu fosfoproteoma).

Também há os projetos “imunomas”. O imunoma é por definição, o conjunto de epítopos que pode ser gerado a partir de um proteoma (próprio ou não), e ser apresentado junto a moléculas de MHC de classe I ou II, ou que são capazes de se ligarem a anticorpos, e que podem dar início a uma resposta imune. A quantidade de variáveis a serem incluídas num projeto imunoma é enorme. Além do imenso repertório de proteínas de um patógeno ou próprias, e sequências de aminoácidos que podem ser derivados delas, temos toda a variedade de moléculas de TCR e BCR que podem ser geradas por um indivíduo por recombinação VDJ. Além disso, são muitas as diferentes moléculas de MHC I e II que um indivíduo pode produzir devido aos polimorfismos. No caso de imunomas para resposta de células B, temos o fator complicante de que não basta testar sequências de aminoácidos que podem se ligar aos anticorpos, pois eles também reconhecem a estrutura protéica quaternária, onde séries de aminoácidos que estão distantes na estrutura primária de uma proteína podem estar adjacentes. Sendo assim, algorítmos poderosos tem de ser construídos para predizer esses epítopos. De qualquer forma, muitas são as aplicações da imunômica. Ela pode ser usada para o desenvolvimento de vacinas, procurando os epítopos mais imunogênicos dos determinados patógenos ou toxinas; pode ser usada na terapia de alergias, determinando-se quais os epítopos de um dado proteoma que podem estar mais associados com a produção de IgE. Também pode auxiliar em terapias para autoimunidade, por determinar quais epítopos imunogênicos podem ser gerados de proteínas próprias, ou até de patógenos que possuem mimetismo e podem gerar reações autoimunes. Esta última abordagem pode ser útil também no caso de transplantes. Em casos de terapias onde se administram proteínas, pode ser montada uma resposta imune contra elas, que vai atrapalhar a terapia. Escaneando-se essas proteínas com relação à sua capacidade de gerar epítopos, surge a possibilidade de tolerizar o indivíduo contra os epítopos, ou usar apenas porções efetoras que não carreguem os epítopos. Também é possível o estudo de virulência de patógenos, pois há trabalhos que mostram que a virulência de certos patógenos pode estar inversamente relacionada à quantidade de epítopos passíveis de serem apresentados e gerar resposta em um indivíduo, proporcionando melhor escape da resposta imune. Da mesma forma, novos trabalhos em imunômica estão acrescentando conhecimento à teoria de tolerância central ou periférica, pois mostram que proteínas próprias possuem capacidade reduzida de gerar epítopos apresentáveis pelas próprias moléculas de MHC comparadas a proteínas não próprias (DE GROOT, 2006). No fim de tudo, assim como nos outros projetos “omas”, surge a “imunômica funcional”, que tenta prever por métodos computacionais qual será o comportamento geral do sistema imune, levando em consideração o estado de ativação que cada um dos epítopos gerados de um patógeno, ou próprios, dependendo do seu poder imunogênico, vai gerar em cada célula do sistema imunológico, como essas células vão interagir, e qual será a resposta efetora final (BRAGA-NETO e MARQUES, 2006).

Depois, prá finalizar, há o “interactoma”, que vai juntar todos os “omas” para entender como pode surgir vida num amontoado de moléculas que é cada organismo... Coisa de louco né...

* Dentro das revisões citadas há vários links para programas computacionais usados nas análises, sociedades, empresas, grupos de pesquisas e consórcios envolvidos nos projetos.

Nita-Lazar A. Quantitative analysis of phosphorylation-based protein signaling networks in the immune system by mass spectrometry. Wiley Interdiscip Rev Syst Biol Med. Sep 10, 2010.

De Groot, AS. Immunomics: discovering new targets for vaccines and therapeutics.

Drug Discov Today, 11(5-6): 203-92006, 2006.

Braga-Neto UM, Marques ET Jr. From functional genomics to functional immunomics: new challenges, old problems, big rewards. PLoS Comput Biol, 2(7): e812006. 2006.

Diego Luis Costa, IBA, USP-Ribeirão Preto.